L’analyse des risques et des préoccupations associés aux divers produits OGM amène la Commission de l’éthique en science et en technologie à retenir quatre valeurs sur lesquelles fonder une évaluation éthique des enjeux liés à de tels produits.
Les préoccupations des citoyens en matière de santé occupent une place prépondérante dans le débat sur les OGM. En Occident, la valeur accordée à la santé est omniprésente et est grandement valorisée autant par les citoyens que par les gouvernements. Ainsi, la perception d’une bonne santé est liée à une saine alimentation et à la pratique régulière d’activité physique.
L’importance accordée à la qualité de l’environnement est la deuxième valeur de référence et est en constante progression. Cela est principalement dû au constat de la dégradation du milieu écologique : l’effet de serre, les changements climatiques et la réduction de la biodiversité menacent l’équilibre des différents écosystèmes sur la planète et contribuent à amplifier l’intérêt pour la protection de l’environnement.
Dans nos sociétés occidentales, la richesse collective est calculée en fonction de l’augmentation de la production des biens de consommation et des échanges commerciaux. La croissance des échanges est un indice de la vitalité de l’économie libérale. Ainsi, le développement et la production d’OGM pourraient générer des retombées économiques pour les pays producteurs. Cette valeur ne peut être négligée parce qu’il existe un lien au sein des sociétés entre la prospérité économique, la qualité de l’environnement et l’état de santé des populations. Toutefois, cette valeur doit s’inscrire dans une perspective de développement durable et dans un souci de justice avec les pays en développement. Il importe aussi de préserver la santé de la population et la qualité de l’environnement.
La population doit être assurée sur le fait que la protection de la santé et celle de l’environnement sont considérées comme des valeurs prioritaires par les organismes gouvernementaux lors de l’approbation des OGM. La transparence des processus d’approbation et la participation des citoyens à la prise de décision sont nécessaires à l’établissement d’un climat de confiance entre la population et les décideurs publics.
À partir de la hiérarchisation des valeurs ci-haut mentionnées et d’une graduation qui fait en sorte qu’elles découlent les unes des autres, la Commission croit qu’il faut raffermir la confiance du public et l’assurer que la protection de la santé n’est pas tributaire des retombés économiques escomptées de ce développement.
L’incertitude scientifique concernant les impacts sur la santé et l’environnement des produits génétiquement modifiés et de leurs dérivés crée un climat de méfiance dans la population. En situation d’incertitude, la Commission de l’éthique en science et en technologie considère que l’adoption d’une approche de précaution est justifiée puisqu’elle permet d’aborder la gestion du risque (quant aux dommages pouvant être causés à la santé et à l’environnement) sans toutefois mettre un frein à la prise de décision. Une telle approche vise la recherche d’un équilibre entre l’innovation technologique et la gestion des risques, tout en favorisant la prudence relativement à l’incertitude.
Sur le plan éthique, plusieurs questions se posent, notamment en ce qui concerne :
Pour plus d'informations, consulter les publications de la Commission 
sur les organismes génétiquement modifiés.
